Clasificarea aminoacizilor

Clasificarea aminoacizilor

O prima clasificare a acestor aminoacizi tine cont, asa cum este firesc, de natura radicalului (R).

1. Amino acizi cu grupari alifatice nepolare (hidrofobi)

1. 2. Aminoacizi care contin grupare hidroxil legata de radical alifatic

1.3. Aminoacizi care contin sulf legat de radical alifatic

2. Aminoacizi cu caracter acid si amidele lor

3. Aminoacizi cu caracter bazic

4. aminoacizi cu radicali aromatici

5. Aminoacizi cu ciclu iminic

Dupa cum se observa, denumirile aminoacizilor sunt cele comune. In biochimie sunt acceptate astfel de denumiri alaturi de cele stabilite pe baza recomandarilor IUPAC (Uniunea Internationala de Chimie Pura si Aplicata), care se folosesc mai rar. Pentru ca in compozitia proteinelor numarul de aminoacizi este uneori imens, s-au adoptat de asemeni notari prescurtate, fie din trei litere, fie din una singura, care au fost prezentate mai sus in tabelele cu aminoacizi, usurandu-se astfel prezentarea compozitie unei proteine.

Asa cum s-a aratat mai sus, aminoacizii principali pot fi diferentiati dupa gruparea R legata de carbonul a fata de gruparea carboxilica. O alta clasificare poarte fi facuta dupa natura hidrofoba sau hidrofuga a acestei grupari. Aminoacizi hidrofobi tind sa respinga mediul apos, redistribuindu-se astfel spre interiorul proteine. Acestia nu ionizeaza si nu participa la formarea legaturilor de hidrogen. Aminoacizii hidrofili tind sa reactioneze cu mediul apos implicandu-se adesea in formarea de legaturi de hidrogen. Acestia se gasesc la suprafata exterioara a proteinelor sau in centrele reactive ale enzimelor.